Префектура расположена на западе острова Кюсю. Граничит с севера с Фукуокой, с северо-востока — с Оитой, с востока — с Миядзаки, с юга — с Кагосимой.
Южные и северо-восточные районы префектуры Кумамото гористы. В центре расположена обширная равнина, где проживает большинство населения префектуры. Административный центр — город Кумамото.
Ранее этот район был известен как провинция Хиго. Здесь ощущалось сильное влияние культуры континентальных соседей — Кореи, Китая. В 1637 г . провинция стала центром т.н. Симабарского восстания под христианскими лозунгами.
Основа экономики — сельское хозяйство. Выращиваются рис, фрукты, овощи.
Развитие промышленности долгое время сдерживалось удаленностью от основных индустриальных центров страны. И по сей день Кумамото не может похвастаться своим промышленным потенциалом.
Среди достопримечательностей выделяется активный вулкан Асосан, а также сохранившие природную красоту острова Амакуса, где расположен один из национальных природных парков. В городе Кумамото объектом повышенного внимания туристов является крепость, построенная в 1601 г .
Площадь префектуры — 7408 кв. км, население — 1840 тыс. человек.